临床表现为胸痛，可有肩背部放射痛，干咳偶有少量黏痰或脓痰。肺脓肿时，咳痰为典型的巧克力色，并有高热、盗汗、食欲不振等全身中毒症状。阿米巴肝脓肿破入肺及支气管后，可突然咳出大量巧克力色脓痰，伴剧烈胸痛和呼吸困难，偶有胸膜休克，最终形成肝膈胸膜腔瘘。也可穿破皮肤形成肝、膈皮肤瘘，外排黏稠巧克力色脓液，经久不愈。体格检查可见右侧肺部实变、呼吸音减弱、湿啰音或胸腔积液，合并肝脓肿可有肝大，压痛，50%合并杵状指。