本病的预防主要是避免接触病原体的感染，同时应做到早期发现、早期诊断、早期治疗的方针。同时非典型分枝杆菌的感染主要见于体质低下、消瘦、平常缺乏体育运动的患者，故预防方面应针对这一特点进行，增加运动，提升体质、加强营养等可以降低患病率。对于已感染的患者注意隔离和防护也能够减少本病的传播。