阴茎海绵体受累时，阴茎勃起弯曲和疼痛，有时可形成瘘管。结核杆菌可以经尿道上行性感染影响膀胱、输尿管、肾脏，导致膀胱结核、输尿管结核、肾结核，可以出现血尿、脓性尿以及尿频等改变，同时可并发输尿管堵塞(称作肾自截)、膀胱挛缩，使膀胱容积减小，并发严重的尿频。