大多数交叉异位肾病人无症状，如果有症状常在中年发病，包括模糊的下腹痛、脓尿、血尿和泌尿系感染。异常的肾位置和异位的血管可引起梗阻而致肾积水和结石形成。有的病人可有无症状的腹部肿块。临床上遇到下腹部活动性肿块时，应想到异位肾可能。