睡眠障碍可以是某些疾病的并发症状，失眠也可能导致机体的生理活动发生一系列改变，对机体其他系统的功能亦有影响。长期缺睡可以引致许多神经、精神及亚健康症状。如烦躁、抑郁、警觉和活动能力下降，自主神经功能紊乱、消化功能障碍等;甚至会降低免疫机能，影响身体健康及工作效率，使生活质量下降。反之，躯体功能障碍可以是睡眠障碍的诱因，也可能是睡眠障碍的并发症。