非器质性阴道痉挛主要与性交疼痛相鉴别。二者均有性交时阴道疼痛。但非器质性阴道痉挛疼痛较轻，主要是阴茎不能纳入阴道进行性交。性交疼痛是以疼痛为主，并可有小腹疼痛，疼痛发生在性交后小时或数天，而勃起的阴茎尚能插入阴道进行性交。