对于纵膈囊肿可并发气管支气管瘘、食管瘘、胸椎破坏等并发症。对于纵膈肿瘤可并发呼吸困难和吞咽困难，恶性者可发生转移。胸腺瘤可合并重症肌无力症和红斑性狼疮。如果明确是恶性肿瘤的患者，可造成远处器官的转移，形成继发性的肝癌以及骨肿瘤等。