原发灶不明而以脑症状为首发症状时，临床上易误诊为结核性脑膜炎、颅内占位性病变、脑猪囊尾蚴病(囊虫病)等。鉴别的方法通常是根据临床查体以及实验室检查。如性头颅CT以及MRI检查如果是囊虫病者可发现明显的囊虫样水肿征。是否为结核可行脑脊液生化检查明确脑脊液里面氯离子的含量。