食管息肉合并食管扩张的病人应与贲门失弛缓症相鉴别;食管腔内的某些息肉样恶性肿瘤相鉴别，如食管癌肉瘤、假性肉瘤(pseudosarcoma)、食管鳞癌等，食管钡餐造影检查与内镜检查时其大体外观类似息肉，需要与食管良性息肉相鉴别。