少年性跟骨骨骺骨软骨病常发病于青少年快速生长期，绝大多数患者就诊的主要原因是跟骨的畸形。其中部分患者可能会合并关节疼痛，50%的患者主诉疼痛，主要位于畸形部，活动后加重。通常随生长结束而减轻，接近成熟期后只有25%的患者有较典型症状。