饮水须煮沸，不吃生菜，防止饮食被污染，如果不慎饮用了可疑污染的水源以及食物可以口服甲硝唑或者替硝唑进行预防性治疗。防止苍蝇滋生和灭蝇，减少阿米巴原虫传染机会。检查和治疗从事饮食业的排包囊者及慢性患者，治疗期间应调换工作。平时注意饭前便后洗手等个人卫生。