胃肠道的类癌常常在早期发生肝脏转移，而且部分也有类癌综合征的表现。因此，在诊断肝脏类癌时，首先应该进行广泛而细致的检查，部分病例甚至还需要经过长期的随诊观察，以彻底排除其他部位的类癌存在。此外，肝脏类癌还要与肝细胞癌相鉴别，后者与肝脏类癌的临床发展不同，无类癌综合征的表现，多在肝硬化基础上发生，大部分甲胎蛋白(AFP)增高，免疫组织化学和电子显微镜检查肿瘤细胞无类癌的特性。