纤维肌痛综合征见于各种风湿病(骨关节炎、类风湿关节炎和系统性红斑狼疮等)及各种非风湿病(如甲状腺功能低下、恶性肿瘤和外伤等)。
　　中枢神经系统功能异常：纤维肌痛综合征患者存在疼痛刺激阈值降低及痛觉过敏现象，较低痛觉刺激就会导致患者明显疼痛。
　　神经内分泌功能异常：研究证实，纤维肌痛综合征患者存在下丘脑-垂体-肾上腺轴和下丘脑-垂体-甲状腺轴应激障碍。
　　纤维肌痛综合征患者股四头肌活检中存在细胞基膜空袖、脂褐质小体和其他退行性改变，提示纤维肌痛综合征患者可能存在局部肌肉血液灌流减少。