小儿再生障碍性贫血并发症主要为：重症和病情进展迅速者常并发缺血缺氧和心功能不全表现;并发严重感染和内脏出血，尤其颅内出血常危及小儿生命;若反复输血可致含铁血黄素沉着症，导致重要脏器功能损害;可并发心功能不全、营养缺乏、生长障碍等。