严重者可依寄生部位的不同而出现不同的并发症，如：阑尾炎、盆腔炎、腹膜炎、肠梗阻等病人大多于感染后1～2个月逐渐出现上腹部不适或疼痛、食欲减退、腹泻、乏力、消瘦等肝囊型包虫病有肝区隐痛，上腹部饱胀感、消化不良、消瘦、贫血、肝大、上腹部包块等。肺囊型包虫病有胸部隐痛、刺痛、胸闷、咳嗽、气短、咯血，有时随痰咳出粉皮样内囊碎片或子囊，或在痰液镜检
时发现原头节的头钩。