眼结膜水肿其病因不外乎微生物性与非微生物性两大类。就微生物性而言，细菌、病毒、寄生虫等均可引起结膜炎症，而且来源甚为广泛，可直接来自外界，也可来自自身，而自身感染又可能通过血流或淋巴液转移至结膜(结核等);或由邻近组织，如眼球本身(角膜、巩膜)、眼眶、鼻腔与副鼻窦、泪器、周围的眼睑皮肤直接蔓延而来。就非微生物病因而言，机械的、物理的(热、放射、电)、化学的、以至全身过敏状态和一些全身代谢性障碍(如风湿、痛风)皆可成为致病因素。

角膜是眼球最前面的一层透明的薄膜，经常暴露在空气里，接触病菌机会多。常因异物等外伤，角膜异物剔除后损伤以及沙 眼及其并发症、内翻倒睫刺伤角膜，细菌、病毒或真菌乘机而入，引起感染而发生角膜溃疡。此外，如结核引起的变态反应、维生素A缺乏、面瘫及眼睑疤痕致眼睑闭合不良均可引起角膜溃疡。