鉴别诊断首先与小螺菌鼠咬热相区别，此外与其他原因引起的皮疹相鉴别，如风疹、败血症、流脑及药物性皮疹等。哈佛希尔热还应与其他原因引起的腹泻、呼吸道感染相鉴别。