其临床表现亦多样化。潜伏期数天至20年，大多在1年内。按其侵犯的主要器官不同，临床上可分为4型：

1.胸肺型 肺为卫氏肺并殖吸虫最常寄生部位，咳嗽、血痰、胸痛最为常见，典型的痰为棕褐色可持续数年。如伴肺组织坏死则呈烂桃样血痰，当肺并殖吸虫移行入胸腔时，可引起胸痛，渗出性胸膜炎或胸膜肥厚。四川并殖吸虫引起胸痛、胸腔积液较多，而咳嗽血痰较少。

2.腹型 以腹痛、腹泻、肝肿大为主要表现。腹痛以右下腹痛最多见，轻重不一。可有腹泻棕褐色脓血便，里急后重，脐周有压痛，偶可扪及结节或肿块。虫体在腹腔移行可引起腹腔积液或广泛炎症粘连。四川并殖吸虫常侵入肝脏，在肝内形成嗜酸性肉芽肿。

3.结节型 以皮下或肌肉结节最多见，约20%的卫氏并殖吸虫病患者有此征象。多位于下腹至大腿间皮下肌肉。结节内可见成虫虫卵、嗜酸性细胞和夏科-雷登结晶。四川并殖吸虫病主要表现是游走性，皮下结节或包块，其发生率50%～80%，结节和包块1～6cm大小，好发部位为腹壁，其次为胸壁、腰背及大腿内侧。

4.胸型 多见于儿童与青少年。早期可有头痛、呕吐、脑膜刺激征和颅内高压表现，稍后有癫痫、幻视、感觉异常等定位症状。侵犯脊髓则有脊髓受压、下肢感觉、运动异常，尿潴留，截瘫等症状。

根据流行病学资料，尤其是到过流行地区并有吞食活的囊蚴机会;有上述临床表现，胸部X线征象，嗜酸性细胞增高，应考虑诊断。痰、粪便、皮下结节的活检找到虫卵或虫体可确诊。免疫学检查对病原体检查阴性者有诊断意义。